長崎県の西方，五島列島の北部の中通島のほぼ中心部になる新上五島町阿瀬津郷に位置する本校は，明治７年に太田小学校鯛ノ浦分校として創設された歴史と伝統のある学校です。

昭和２２年の学制改革により，有川町立東浦小学校と改称し，平成１６年８月，町合併により，現在の新上五島町立東浦小学校となりました。

また，平成２１年４月には，新上五島町立神之浦小学校と統合され，現在の，七目・中野・阿瀬津・奥浦・鯛ノ浦・神ノ浦地区が校区となりました。

平成２４年４月９日現在で，児童数９３名，通常学級６学級，特別支援学級１学級の合計７学級からなる小規模校です。